當前熱訊：多場景布局三代測序，貝瑞基因要“一鍵解決”單基因全病種檢測

近日，山東省藥械集中采購平臺一則公告，讓SMA再度進入大眾視野。公告顯示，SMA口服藥利司撲蘭主動申請降價，調(diào)整后價格為每瓶1.45萬元。按年齡體重計算，價格調(diào)整后最大使用劑量患者年治療費用將低于45萬元。據(jù)了解，利司撲蘭今年將繼續(xù)參與國家醫(yī)保談判。而就在去年年底，經(jīng)歷談判代表的“靈魂砍價”，用于治療SMA的“天價藥”諾西那生鈉注射液納入國家醫(yī)保，每支價格從70萬元直降到3.3萬元，一時引發(fā)熱議。

SMA即脊髓性肌萎縮癥（Spinal Muscular Atrophy），是一類由脊髓前角運動神經(jīng)元變性導致肌無力和肌萎縮的遺傳性肌肉疾病。SMA為嬰幼兒中第二常見的致死性常染色體隱性遺傳病，人群攜帶率為1/72-1/47，發(fā)病率為1/10000-1/6000。雖然SMA治療藥物已納入醫(yī)保或正在積極進入醫(yī)保的路上，但其終生治療費用對大部分家庭而言，仍然十分昂貴，且患者的治療為修正治療而不能根治。因此，SMA攜帶者篩查才是最有效的應對方式。

(資料圖片僅供參考)

有研究表明，三代SMA（基于三代測序）是相比qPCR、MLPA等傳統(tǒng)檢測方法，對遺傳病的覆蓋更全面，檢測更精準，有重大應用價值。今日，貝瑞基因向外界公布了三代科研的最新進展：由公司參與完成的三代SMA（脊髓性肌萎縮癥）臨床回顧性研究成果，已近期發(fā)表于分子診斷領域權威國際學術期刊Journal of Molecular Diagnostics（即時IF=5.568）。

據(jù)介紹，SMA攜帶者分三種情況：91-94%的攜帶者只有一個正常功能的SMN1拷貝（1+0），2-5%的攜帶者含有兩個SMN1拷貝，但其中一個包含致病點突變（1+1D），另外4%為沉默型攜帶者，即有兩個SMN1拷貝，但都位于同一條染色體上（2+0）。目前qPCR、MLPA等傳統(tǒng)基因檢測方法無法檢測1+1D和2+0攜帶者，殘余風險最高可達1/415（1/1245-1/415）。

貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林表示，三代測序具有超長讀長、無GC偏好、對高度重復等復雜區(qū)域也能夠準確測序等技術優(yōu)勢，且技術成本持續(xù)下降，2025年將實現(xiàn)與二代測序成本持平。在此基礎上，貝瑞基因開發(fā)出三代SMA基因全面檢測（Comprehensive analysis of SMA, CASMA）技術，可實現(xiàn)SMN1及SMN2基因近30kb全長序列的高效率三代HIFI測序。CASMA還能同時檢測SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)、全基因范圍內(nèi)致病性SNVs及Indels，并主動提示沉默型“2+0”的攜帶風險。

此次三代SMA回顧性臨床研究，CASMA一次性精準檢測所有337例樣本的SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)，對SMN1拷貝數(shù)缺失的檢測靈敏度高達100%。CASMA還成功檢測出4例會被qPCR、MLPA等傳統(tǒng)方法漏檢的SMN1基因點突變攜帶者（1+1D）。通過專利分析方法，CASMA直接預測出全部7例（來自4個家系）已知“2+0”型攜帶者。數(shù)據(jù)顯示，CASMA能大大改善SMA患者基因診斷及預后判斷，提高SMA新生兒基因篩查效率，將攜帶者檢出率從91-94%提高到98%以上，將殘余風險降低4-5倍。

據(jù)介紹，三代SMA只是貝瑞基因三代測序臨床轉(zhuǎn)化體系中的一塊拼圖，無論是科研還是產(chǎn)品落地，都遠遠不止于此：不久前，由貝瑞基因提供技術支持的三代CAH（先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥）臨床回顧性研究成果，發(fā)表于檢驗醫(yī)學領域權威國際學術期刊Clinical Chemistry（即時IF=11.784）；更早一些，2021年上半年，公司發(fā)起了地中海貧血基因圖譜（TiGA）計劃。2021年7月，由貝瑞基因提供技術支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在The Journal of Molecular Diagnostics上發(fā)表。

截至目前，貝瑞基因已將三代測序技術觸達多種罕見病，三代地貧、三代CAH、三代SMA等產(chǎn)品相繼落地。其中，三代地貧檢測試劑盒近期取得醫(yī)療器械注冊倫理批件，進入臨床試驗階段。三代CAH和三代SMA技術則在2022年雙雙取得發(fā)明專利證書。

至于三代測序的下一站應用場景，貝瑞基因表示，是要“一鍵解決”單基因全病種檢測。根據(jù)貝瑞基因官方介紹，因為公司的各種產(chǎn)品是高度兼容，所以更容易實現(xiàn)一次性解決多種疾病，而從一到多，準確性不會受到影響。

“根據(jù)貝瑞基因目前的發(fā)展策略，是在三代測序儀上開發(fā)單病的復雜結構基因突變或者基因結構導致的單病一次性測定方法和試劑盒；未來則是隨著臨床的驗證和市場的接受，逐漸將這些單一產(chǎn)品打包整合，讓越來越多的疾病納入到二代和三代的平臺上，形成一套有效的、能一次性測定指定病種致病基因情況的產(chǎn)品?！?/p>

任志林解釋到，其實大部分人在年輕時候都沒有什么遺傳病表型，但也都會面臨一定的風險，對于每個個體來說，如果把全基因組做了，風險基本上接近100%?！耙簿褪钦f，每個人都或多或少會有一些致病基因的攜帶情況，只不過因為孟德爾遺傳，同一個致病基因在配偶身上同時攜帶的概率低，但一旦懈怠這個致病基因，就存在25%的生育下一代患兒的風險?！?span style="letter-spacing: 0px;">從疾病自身的角度來說，CAH、地貧、FXS、SMA等，單病發(fā)病風險并不高，但在生育過程中，夫妻雙方單個人攜帶的風險其實是很高的，這也是治病基因攜帶者篩查市場的需求高漲的關鍵原因。

他也指出，目前在市場供給端方面，大陸地區(qū)還沒有特別成熟的實際應用。在貝瑞基因看來，未來最大的應用場景還是攜帶者篩查，隨著數(shù)據(jù)量越來越大，得到更廣泛的臨床認可，市場也將迎來爆發(fā)。

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